在南京进行司法亲子鉴定时，需要注意以下几个关键点，以确保鉴定过程的合法性和结果的准确性：

选择正规鉴定机构
资质审查：务必选择具有司法部门颁发的《司法鉴定许可证》的机构，并确认该许可证在有效期内。同时，机构应具备法医物证鉴定资质，这是进行司法亲子鉴定的基础。
人员资质：鉴定机构应至少有两名具有法医物证鉴定人职业资格的法医，且这些法医应是鉴定中心的在职人员。在选择机构时，可以核实法医的执业证书和在职情况。

准备必要材料
身份证明：所有参与鉴定的人员（包括父母和子女）均需提供有效的身份证明，如身份证、户口本、护照等。这些证件将用于核实身份和存档。
委托书：如果鉴定是应法律程序要求或用于法律事务，如落户、诉讼等，需要提供法院或相关机构的委托书。

遵循鉴定流程
现场申请：所有鉴定人需亲自前往司法亲子鉴定机构，向法医提出申请，并明确鉴定目的。
填写表格：在法医的指导下，填写相关的鉴定申请表或委托书，确保信息准确无误。同时，需要留下指纹作为证实。
现场采样：由鉴定机构的专业法医在现场采集DNA样本，通常包括血痕、带毛囊的头发、口腔拭子等。采样过程将全程录像，以确保公正性和准确性。
缴费与等待：支付鉴定费用后，等待鉴定机构出具鉴定报告。通常，报告将在3-7个工作日内出具，但具体时间可能因机构而异。

注意保密与隐私
保密原则：鉴定机构应确保参与者的个人信息和鉴定结果的保密性，不得泄露给无关人员。
隐私保护：虽然司法亲子鉴定需要公开身份和提供必要材料，但机构应采取措施保护个人隐私，避免不必要的曝光。

确认鉴定结果
报告审查：在收到鉴定报告后，应确认报告上是否涵盖了司法鉴定机构的印章，并确认参与鉴定实验的法医均已在报告中签署实名。这样的报告才具有法律效力。
结果异议：如果对鉴定结果有异议，可以向鉴定机构提出复议申请，或寻求法律途径解决争议。

在南京进行司法亲子鉴定时，需要选择正规机构、准备必要材料、遵循鉴定流程、注意保密与隐私以及确认鉴定结果。这些步骤将有助于确保鉴定的合法性和结果的准确性。