在合肥进行上户口亲子鉴定，需要准备的材料主要包括以下几个方面：

一、身份证明材料
父母双方及孩子的身份证件：包括身份证、户口本、护照、驾驶证、军人证等能够证明身份的证件。父母双方需要提供原件和复印件，孩子如果已有身份证件，也应提供原件和复印件。
结婚证：如为婚生子女，父母双方的结婚证也是必要的材料。非婚生子女则无需提供结婚证。
二、亲子鉴定申请书
申请书撰写：通常由鉴定申请方（如父母）撰写，明确鉴定目的（如上户口所需），并包含相关人员的基本信息（包括姓名、身份证号、联系地址等）。
格式与要求：申请书的格式和要求可能因不同鉴定机构而有所不同，一般在申请时可以由鉴定机构提供标准模板。
三、其他相关材料
出生医学证明：如孩子已有出生医学证明，应提供原件和复印件。如无出生医学证明，则需通过亲子鉴定来证明亲子关系，并据此申领出生医学证明。
公安机关或相关部门要求的其他文件：在某些特殊情况下，如孩子因非婚生子女身份办理户口，可能需要提供未婚生育的相关证明。这类文件的主要目的是配合鉴定流程，确保亲子鉴定程序合法合规。
四、注意事项
选择正规鉴定机构：确保所选鉴定机构具备司法鉴定资质，这是鉴定报告具有法律效力的前提。
提前咨询与预约：在进行亲子鉴定前，建议提前咨询当地派出所、户籍管理部门或鉴定机构，了解具体的材料要求和鉴定流程。
现场采样与身份验证：被鉴定人需携带相关证件到司法鉴定中心进行采样和身份验证，如验证身份证明、留指纹、照相等。
综上所述，合肥上户口亲子鉴定需要准备的材料包括身份证明材料、亲子鉴定申请书以及其他相关材料。在准备这些材料时，请务必确保信息的真实性和准确性，以便顺利完成亲子鉴定和上户口手续。