在选择合肥匿名亲子鉴定机构时，可以从以下几个方面进行考虑：

一、机构资质与专业性
查看资质：
确保所选机构具有合法资质，如《司法鉴定许可证》等。这是衡量机构是否正规、专业的重要依据。
可以在国家司法鉴定名录网等官方网站上查询机构的资质信息。
了解专业性：
考察机构是否拥有经验丰富的技术人员和先进的DNA检测技术。
询问机构的服务范围、鉴定流程以及样本采集、保存和检测的标准。
二、隐私保护
保密措施：
询问机构在客户咨询、办理手续、鉴定报告领取等环节中是否设置了保密措施。
确保机构能够严格保护客户的隐私信息，不泄露给第三方。
匿名服务：
了解机构是否提供匿名亲子鉴定服务，即客户无需提供身份信息即可进行鉴定。
三、服务流程与便捷性
服务流程：
询问机构的服务流程是否清晰、规范，包括预约、采样、缴费、实验、通知结果等环节。
了解机构是否提供线上咨询、电话咨询或现场办理业务等多种服务方式。
便捷性：
考察机构的地理位置是否便利，是否有多个采样点或分支机构。
了解机构的预约服务是否方便，能否满足客户合理安排时间的需求。
四、价格与性价比
价格透明：
询问机构的价格标准是否明确、透明，是否存在隐性收费。
性价比：
综合考虑机构的服务质量、技术水平、隐私保护以及价格等因素，评估其性价比。